Quelques années après la série Yu-Gi-Oh Duel Monster, sur une île isolée du reste du monde, se trouve le premier lycée de Duel de Monstres, la Duel Academy ! Cet internat spécial instruit de jeunes duellistes prometteurs pour qu'ils développent leur pleine compétence aux duels de cartes. Cependant, les étudiants vont se rendre compte qu'un des plus grands duellistes de tous les temps est sur le point d'arriver dans un des classes de l'académie de duel...
Les étudiants, classés à la fois par des rangs de duelliste et des examens, sont séparés dans trois dortoirs. Les étudiants les plus avancés résident dans le dortoir bleu d'obélisque, Obelisk Blue. Le deuxième niveau vit dans le dortoir jaune de Ra, Ra Yellow. Les duellistes avec les qualités les moins bonnes au cours des duels sont dans le dortoir rouge d'Osiris, Slifer Red. Des conflits entre les classes ont lieux depuis des années avec un dortoir mieux classé (Obelisk Blue) qui ne cesse de taquiner les dortoirs de plus faible niveau, mais le statu quo est sur le point d'être boulversé avec un nouvelle arrivée !
Les étudiants, classés à la fois par des rangs de duelliste et des examens, sont séparés dans trois dortoirs. Les étudiants les plus avancés résident dans le dortoir bleu d'obélisque, Obelisk Blue. Le deuxième niveau vit dans le dortoir jaune de Ra, Ra Yellow. Les duellistes avec les qualités les moins bonnes au cours des duels sont dans le dortoir rouge d'Osiris, Slifer Red. Des conflits entre les classes ont lieux depuis des années avec un dortoir mieux classé (Obelisk Blue) qui ne cesse de taquiner les dortoirs de plus faible niveau, mais le statu quo est sur le point d'être boulversé avec un nouvelle arrivée !
